战斗开始，敌军将领为索洛·基。采用修的计策，一见索洛·基的部队遭受狙击，原南窗部队的战士纷纷撤退，王国军吃了败仗。回根据地以后，主人公受到了热烈的欢迎，大家都被胜利的喜悦包围着。
修想以北窗为根据地，正式成立一个新同盟军，他希望主人公能担任领袖的职务。维克多认为主人公需要时间考虑，他叫七美和主人公晚上来找他，他将代替阿尔贝那，把玄客的故事告诉两姐弟。
晚上，维克多对主人公讲述了玄客的故事。主人公仍在犹豫之中。翌日，在众人的力劝之下，主人公终于答应接受领袖一职。门之纹章的继承人莱克那多忽然出现，她将约定的石板托付给主人公，并让自己的弟子洛克留下帮助主人公。方安大夫也赶来为主人公献上一己之力。主人公的同伴渐渐汇集起来，根据地的队伍也在不断壮大。
新同盟军成立的第二天清晨，根据地的广场上来了一个陌生男子。男子自称名叫费嘉，是原妙芝的使者，现在成为托利巴市的使者，在妙芝时，和主人公等，曾有一面之缘。费嘉对新同盟军打败王国军的战役评价很高，希望新同盟军能和托利巴结盟，共同对付王国军。众人同意结盟，认为这样能提高新盟军的战斗力。前往托利巴目前只有水路，根据地虽然有船，但没有船夫，主人公遂出发去寻找能开船的人。
在拉达托，主人公找到阿马达。在克斯克斯街，主人公找到杨空和大丰。阿马达开船带主人公来到雷克西街。留下一封介绍信后，费嘉先行离开。一行人朝雷克西西面的托利巴继续前进。
刚进入托利巴，主人公就和一个背后长翅膀的少年撞个正着。托利巴市政厅前，警卫向主人公索取介绍信，大家发现介绍信与钱包全被偷走，估计是那少年所为。
为了追回介绍信，主人公跟随少年一直到他居住的村落。原来少年是翼族一员，名叫查柯。查柯无路可逃，便扇动翅膀飞走了。他告诉主人公介绍信已经被丢了。主人公空手返回托利巴。
市政厅门口，利多利怀疑费嘉逃跑和撒谎，要责罚他100军鞭，主人公及时赶到，救下费嘉。凭着手上的纹章，主人公证明了自己的身份。托利巴的全权大使马卡依接待了主人公。
马卡依告诉大家，托利巴一带狗波鲁多、、翼族和人类混居、，翼族少年偷盗成性。马卡依安排主人公一行人在旅馆“若叶亭”住下、，第二天再商量结盟事宜、。
翌日，主人公到达市政厅时、，马卡依和利多利正在发生争执、。利多利指责马卡依是个叛徒，说再也不愿意借助人类的力量了、，尔后拂袖而去、。主人公受马卡依之托，前往狗波鲁多村询问究竟发生了什么事情、。
狗波鲁多村口、，警卫不放主人公过去。无奈之下、，众人原路折回、，在路上又碰到了查柯，查柯偷走了费嘉的钱包、，潜入一个地下通道后消失不见了、，众人跟随进入。
地下通道出口的另一端、，原来就在狗波鲁多村的训练场里、。利多利告诉他们，狗波鲁多村的巡逻队在半夜发现了一封密信、，信里说、，以把托利巴市内狗波鲁多族居住地的支配权交给王国军为条件，托利巴将和王国军缔结休战协议、。利多利表示从此不再相信人类、，把主人公等送出了狗波鲁多村。
返回托利巴┃，大家撞见王国军将领奇巴父子为休战事宜会见马卡依。大家立刻明白这是王国军为离间托利巴和狗波鲁多而设下的计谋 ┃，力劝马卡依不要上当┃，马卡依一意孤行。
离开市政厅众人再次遇见查柯┃，查柯说他奶奶想邀主人公一见┃。另一边，费嘉认为形势紧急┃，向修写信求援┃。翼族村庄里，翼族首领丝丝和主人公讲述了翼族和玄客的渊源。
翌日┃，奇巴父子带领军队大举侵犯托利巴┃，协议不攻而破。托利巴形势危急┃，费嘉和主人公赶回利多利处求救┃。利多利在狗波鲁多族人的要求下终于肯出兵相助。同时┃，翼族也出动族人参加战斗┃。
一方面修率军赶到，前后夹击之下┃，王国军退兵┃。王国军的驻军地里，卢卡质问索洛·基败兵缘由┃，索洛·基后被卢卡处死┃。卢卡下面的目标是绿山，乔伊毛遂自荐接下军令状|，自言能以5000士兵和妙芝的俘虏攻占绿山|。
一方面，在各种族的共同努力之下|，托利巴保住了|。托利巴决定和新同盟军结盟，并派费嘉为修所用|。查柯也愿意加入同盟军发挥作用|。大家返回根据地。
第三章
根据地里|，修告诉众人|，绿山已经落入王国军手中，新同盟军和托利巴虽然没有实力收回绿山|，但是必须把绿山代理市长泰来兹营救出来|，这样在收复绿山的时候，就能得到老百姓的支持|。修让主人公等扮成学生潜入绿山|。费嘉先行一步，在绿山安排好一切事宜|。
除了主人公和七美|，可另外选择适龄同伴一起前去绿山，弗里克作为名义上的领队眧；ぶ谌藎。绿山在托利巴的东北面|。
绿山入口处，费嘉把入学通知书交给了弗里克|。绿山广场上|，一个女孩和王国军起了冲突，主人公上前制止‖，弗里克执剑喝退了王国军‖。女孩是绿山的学生，名叫尼娜‖。
弗里克陪同下‖，大家到绿山新叶学院里递交了入学通知书。学院老师爱米利亚安排大家住在学生宿舍‖。参观学院时‖，大家遇见了绿山代理市长泰来兹小姐的手下希恩。
在从学院回宿舍的途中‖，众人又遇见尼娜‖。看见弗里克‖，尼娜的倾慕之情溢于言表‖。
七美很喜欢学校的生活和学校的食物。宿舍楼里‖，尼娜说自己想和七美成为好朋友‖，七美很紧张。
翌日清晨‖，宿舍门口弗里克拦下主人公‖，告诉他们他怀疑泰来兹的失踪和希恩有关，希望主人公利用小孩的身份在绿山四处打探一下‖，说完话后弗里克匆忙逃跑‖。尼娜跟上，说自己为弗里克做了便当‖。
绿山的旅馆外‖，旅馆主人和王国军起了冲突。王国军称有人举报泰来兹藏身于这家旅馆‖，意欲搜查‖。王国军头目劳德命令放火烧店，希恩出面喝止〓。王国军离去〓，希恩向店主表达歉意〓。
晚饭过后〓，宿舍里〓，尼娜向七美打听弗里克的口味。并告诉七美〓，晚上不要太吵闹〓，小心会被夜游鬼带走，七美受到惊吓〓。
学院生活的第三天〓，主人公一早起床四处打探消息。在学院里〓，尼娜叫住七美〓，七美向尼娜询问夜游鬼的事情，尼娜说很多小孩都亲眼看见〓，可能真的有鬼〓。尼娜又称弗里克亲口说喜欢的人是七美。七美向弗里克求证〓，弗里克表示对小孩子没有兴趣〓。
弗里克带主人公众人到街上去找费嘉，不料费嘉被一群绿山市民围堵〓，他们认为费嘉就是告密叛徒〓，弗里克施计救下费嘉。费嘉告诉弗里克〓，把绿山攻打下的王国军将军在这2〓、3天之内会来绿山，他让大家一定要小心行事。
半夜，众人被一阵奇怪的脚步声惊醒，尾随“夜游鬼”，众人走入宿舍的地下室。点燃地下室墙上未亮的一盏灯，一条秘道出现，沿秘道大家进入绿山学院，看见“夜游鬼”潜伏在墙后。众人上前围住，发现连日来大家所说的“夜游鬼”原来是弗里克。弗里说他发现希恩果然有问题，于是跟踪他来此地。
众人继续往前，却发现希恩神秘消失。主人公移动雕塑，一道暗门在墙上出现。出门进入森林，往前不久，大家发现了一幢小木屋，原来泰来兹一直藏身与此。
尽管希恩阻拦，泰来兹仍然现身。她告诉弗里克绿山被占领的原委：原先被王国军俘虏的妙芝士兵被释放后都来到了绿山，王国军将绿山围住，不久，因为食粮短缺，士兵和市民开始反目成仇，内乱发生，绿山不战而败。
弗里克想带走泰来兹，泰来兹拒绝。她认为自己没有阻止内乱的发生，又弃绿山市民于不顾，已经没有资格担任市长一职。弗里克众人只能返回。
弗里克见劝说泰来兹不行，准备返回根据地。第二天清早，绿山广场上，王国军高额悬赏捉拿泰来兹。乔伊以王国军军团长身份现身，宣布已经对劳德有违条约的搜查行为进行惩戒。七美等人对乔伊的出现十分震惊，比丽佳上前去寻找乔伊，主人公行迹败露。形势紧急之下，费嘉施计扰乱人群，众人趁机从森林小路逃走。
弗里克决定强行带走泰来兹。森林小屋里，尼娜正在劝说泰来兹离开，原来她一直帮希恩替泰来兹办事。泰来兹执意不肯离开，准备自己找到王国军，以免再连累绿山百姓为她受苦。绿山境内，泰来兹被俘之际，尼娜带领绿山百姓出现，尼娜力劝泰来兹，拜托泰来兹珍惜生命，有朝一日能为绿山百姓重新夺回绿山。泰来兹终于省悟，跟随弗里克一行从小路逃跑。
王国军追赶，希恩独自阻拦军队，拜托弗里多照顾好泰来兹。众人继续向前逃，不料乔伊出现。乔伊劝主人公不要再当头领，离开纷繁战乱之地，他说战争的胜败早就已经注定，拖延战争是无意义的，还说黑兰德和都市同盟都不会让卢卡为所欲为的。七美不能接受乔伊为王国军效力的事实，比丽佳则对乔伊恋恋不舍。追兵即至，弗里多强行带走众人。
由于放跑主人公，乔伊遭受劳德诘问�？陕薷杂胂Ｒ恋绿媲且量眩且粮屑��？陕薷杂胂Ｒ恋滤德āげ祭程卮吹恼铰抑换峄姆狭撕诶嫉拢窃敢舛郧且列е�。
弗里克带领泰来兹回到根据地、。随后，费嘉带着希恩和尼娜也赶到、。
王国军驻地、，卢卡对乔伊不费兵卒就把绿山拿下的战绩十分满意，问乔伊要什么奖赏、，乔伊说他要的是黑兰德的公主卢卡的妹妹、。卢卡欣赏乔伊的气度，乔伊则另有计划要告诉卢卡、。
修想和马蒂尔骑士团结成同盟、，让主人公前往骑士团所在地洛卡可斯城一趟、，七美执意要一同前往。他们从绿山附近的一条森林小道走、。
森林里、，马蒂尔骑兵团青骑士团长麦克罗托夫将主人公一行迎进城。
骑士团领袖古尔德接见了主人公众人、。古尔德态度傲慢口出狂言、，十分看不起还是一个孩子的主人公，安排主人公住上几天就打发他们走、。
夜晚、，洛卡可斯的客房里，门之纹章的继承者莱克那多再次出现、。她告诉主人公、，战争渐露狰狞，还会流更多的眼泪和鲜血、，她要主人公面对现实、，不要逃避，要改变命运和开辟新的未来、。
翌日┃，洛卡可斯大殿上，红骑士团长卡米欧报告┃，为追赶逃到骑士团境内的妙芝的流民┃，王国军大军压境，卡米欧希望古尔德出兵援助妙芝的流民┃，古尔德应允┃。主人公也参加战斗。
谁知道骑士团大军只是在境内观望┃。古尔德的理由是骑士团境外的事情┃，骑士团没有任何理由和权力出手。流民最终被王国军抓走┃。王国军撤退┃，没有对骑士团有进一步行动。
洛卡可斯城里┃，主人公无意中听见麦克罗托夫想擅自前往妙芝调查究竟出了什么事情┃。卡米欧阻拦不住麦克罗托夫┃，只好拜托主人公费心照顾┃。
在通往妙芝的关卡，麦克罗托夫怕被人识破，想混在主人公队伍中┃，不料守卫还是认出青骑士团长了┃，并告诉麦克罗托夫卡米欧带来口信，嘱咐他要小心┃。
快进入妙芝城时┃，忽然一道不明紫色光束从城内飞起，在空中舞动变化┃，最后汇集成一个狼模样的野兽┃。
琼斯顿山上，卢卡欣赏着仇恨的野兽被释放|，他的狂笑和仇恨充满了整个大地。妙芝市内|，主人公走向琼斯顿山|。一名男子从会场跌撞跑出，声称家人全部被银色的怪物给吞噬了|。主人公被王国军发现|，只能暂时离开妙芝。
洛卡可斯城里|，麦克罗托夫将妙芝上空的怪兽以及妙芝市民被虐杀的惨状汇报给古尔德|，希望古尔德能出兵援助妙芝，却被古尔德一口拒绝|。为维护正义|，一直以身为骑士而骄傲的麦克罗托夫不惜违背骑士的誓言，卡米欧响应麦克罗托夫|，带领一批骑士纷纷倒戈|。他们愿意追随主人公参加战斗。通往骑士团的森林小道里|，修带军队前来接应|。大家顺利返回根据地。
回到根据地|，七美和主人公都松了一口气|。虽然没有和骑士团结盟，但从骑士团来的军队增强了同盟军的兵力|。战争又要开始|，主人公需要好好休息一下。
皇都路路若由|，卢卡对王国军将领奇巴父子忌讳颇多‖。新来的王国军军师莱昂·西尔巴巴古曾担任过赤月帝国的军师，他自称有奇策对付奇巴父子。
根据地接到报告‖，有王国军出现在拉达托街上‖。维克多带着主人公和七美等到拉达托打探情况。拉达托大街上‖，奇巴父子宣布这条街由王国军接管‖，并且保证保障当地百姓的安全。奇巴的儿子克劳斯发现主人公‖，他告诉主人公他会全力出战的‖。
修认为，与奇巴的对决是一场实力之战‖。第一场战争中‖，利多利不知为何忽然临时撤兵，没有取得胜利‖。返回根据地后‖，修重新拟定了作战计划。
皇都路路若由‖，皇王阿卡雷斯·布莱特‖、皇子卢卡·布莱特和乔伊汇集在皇宫正殿里，为乔伊举行骑士册封仪式‖。
乔伊将自己的血滴入葡萄酒‖，宣誓终身效忠黑兰德皇王阿卡雷斯·布莱特，不料皇王饮入酒后忽然倒地‖。原来乔伊事先吃了解毒药‖，再往自己的血里下了毒。--这就是乔伊那日和卢卡密谈商量的暗杀计划‖。
对父亲的憎恨〓，让卢卡在父亲死后，快意大笑〓。
黑兰德再次对根据地发起进攻〓。修让军队兵分两路，一路作为伏兵将敌人包围〓。众人对修的计划心存疑虑〓，修胸有成竹自有妙策。
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