《生化奇兵》作为经典单机游戏讲述了一个非常奇幻的故事，下面给玩家分享下该作的游戏剧情|，希望各位玩家通关后能对《生化奇兵》能有个大致理解‖。
本作讲述1960年主角Jack的飞机突然坠毁在茫茫大西洋一个奇怪的灯塔旁，通过灯塔中的一个球形潜水舱Jack来到了一个叫Rapture的水下大都市〓。Rapture是由一个出生于苏联的工业钜子Andrew Ryan构想，设计、，修建的、。Rapture靠大西洋海底活动火山口所释放的能量，被建造成从水的濉ⅲ化┃，电力到食物，空气等等完全自给自足的梦想乌托邦都市┃。Rapture的居民也是要一个个通过Andrew Ryan本人审查┃，挑选所谓的“人类最杰出的代表”来融入Rapture。自然┃，有人的地方就有阶级┃，Rapture也不例外，随着人口和经济发展┃，社会也被分为不同阶层┃。 从录音资料中可以知道，一个叫Bridgette Tenenbaum的科学家在深海发现了一种独特的海蜗农В可以分泌一种奇特的干细胞┃，科学家称它为“ADAM”。ADAM可以用在医疗上治病┃，但是后来演变开发出一系列基因改造品┃，这种基因改造品可以赋予人类一些奇特本领，后来这些改造品被统称为“EVE”┃。EVE在Rapture疯狂流行┃，从游戏中很多广告标语上可以看到很多对EVE带来的超能力的宣传。但人们并不太了解EVE过度应用所带来的副作用┃，很多人变异发狂┃，直接导致1959年底┃，1960新年来临的当晚惨剧发生。变异的被称为Splicer的人┃，由于变异导致相貌丑陋┃，就用新年party上的兔子面具遮丑，开始疯狂屠杀其他稍微正常的人从而得到其身体里的ADAM┃々В科学家Bridgette Tenenbaum后来创造了我们游戏最后看到的专门培育Little sister的实验室，那个叫“Little Wonder”的地方|。同时也制造出Big Daddy这种半人半机器的怪物来协助Little sister在Rapture各处死人身上回收ADAM|，并通过Little sister和海蜗牛结合的身体把死人的ADAM转化为原始可用的状态|。
Andrew Ryan至一开始就密切关注Jack一举一动|，先以为他是CIA或者KGB的特工，并派来大批变异人Splicer追杀Jack|。这个时候一个自称Atlas的人告诉Jack|，要在目前这种情况下存活，唯一办法就是自己也要拥有超能力|，所以也要用EVE|。后来第一次碰到Big Daddy被Splicer弄死，白拣一个收获Little sister机会时|，科学家Bridgette Tenenbaum出场|，告诉Jack尽量不杀女孩，只杀她体内的海蜗牛|，可见女科学家也是一直关注主角进展|，但Atlas急切希望主角变强大，要他收获女孩的ADAM|，看来这其中有鬼|。
通过游戏进展和录音资料，在Rapture这个社会中|，最先是Andrew Ryan一手遮天|，因为是建造者嘛，市民都要遵守他的法律和意愿生活在他梦想的乌托邦中|，但是这其中冒出个叫Frank Fontaine的人和他对抗|。Frank Fontaine在Rapture主要从事走私活动，慢慢的他就拥有了足够的金钱和支持者来和Andrew Ryan对抗|，自成一派‖。游戏开始就自称Atlas的帮助Jack的人，明显就是和Frank Fontaine一起的‖。从游戏中处处可见写着Atlas的标语可以看出‖，Rapture中有支援Andrew Ryan的一派和支持Fontaine的一派‖，Atlas就是Fontaine的宣传人物。由于Atlas到处宣传市民起来暴动‖，导致他的妻儿被Andrew Ryan抓起来并囚禁在一个潜水艇里面‖，以此来要胁他。这就是最初Atlas帮Jack‖，并想Jack帮他解救他的妻儿的原因‖。但是当Jack后来和Atlas赶到潜水艇处快要碰面时，Andrew Ryan引爆了潜水艇并杀了Atlas的妻儿‖，Atlas悲痛愤怒的要Jack找到Ryan并杀了他报仇‖。
后来当Jack见到在打室内高尔夫的Andrew Ryan的时候，Ryan很平静的和他交谈‖，并暗示Jack其实就是出生在Rapture‖，可以看到画面会闪一下一个头上接着电线仪器的婴儿的画面。游戏中期在一个叫EVE's Garden XXX的脱衣舞酒吧‖，进到后台会发现一张床和一个女尸‖，傍边有录音带，从带中可以听到那个女的和Andrew Ryan发生过关系但不小心怀孕‖，生下一个婴儿‖，这个婴儿就是主角Jack。Andrew Ryan告诉Jack他在小时候被Fontaine训练过并被基因修改‖，然后被送到外面的世界长大‖，目的就是为了在合适的时候回Rapture来杀Ryan。这就解释了游戏开始的坠机不是意外‖，其实是Jack使飞机坠在灯塔入口附近‖，当然是在受到特定基因控制情况下，所以开始他回忆说“you are special”〓。Andrew Ryan为了给Jack证实自己的理论〓，就反复用一种特定语气和字句叫Jack动手杀自己，就是“Would you kindly...”这句开头〓，最初Atlas也是反复用这个开头来控制Jack为他做事的〓。结果Jack果真动手，杀了Ryan〓。玩到这里时〓，其实我不想杀Ryan的，可是游戏强迫杀〓，没办法〓，被控制了。Ryan不过也只是想从溷乱中重新建立Rapture的秩序而已。Ryan死了〓，Atlas的目的达到了〓，高兴的笑了，并告诉Jack他就是Frank Fontaine〓。最前面Atlas一再让Jack收获ADAM变强无非就是想他能更好的为他完成任务而已〓。现在Jack对他也没用了，就打算留他给Ryan的警卫机器人当靶子〓，结果紧急关头Little sister们出手相救〓。
后来Bridgette Tenenbaum出现，原来她一直在Safehouse看管Little sisters〓。她帮助Jack寻找解除Frank Fontaine的基因控制的药水〓，并且告诉他接近Fontaine的最好办法是穿上Big Daddy的抗打套装，变成强悍的Mr.B〓，由Little sister带路去Fontaine老巢对决〓。最后来到目的地，Fontaine为了和拥有EVE能力的Jack对抗，也大量向自己注射过量ADAM，变成一个怪物级BOSS，连Big Daddy的超强抗打套装都喊痛。不过在Little sister的帮助下，用那些没净化过的ADAM和枪炮终于把Fontaine放倒，然后Little sister一拥而上，把Fontaine用针扎死。
《生化奇兵》一共有两种结局，一种结局是最后Jack统治Rapture ，另一种结局是最后Jack带Little sister回陆地过正常人生活了。
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